歐盟碳排放權交易體系（EuropeanUnion Emission Trading System, EU ETS）占歐盟所有溫室氣體排放量的45%左右。在2005年至2014年期間，EU ETS納入企業的溫室氣體排放量下降24%。

自2009年開始，EU ETS開始出現排放配額過剩問題，主要由經濟危機和國際抵消信用進口量過高造成。配額過剩會導致碳價降低，對減排的激勵變弱，不僅會影響碳市場的有效運行，還會阻礙EU ETS有效達成減排目標。由于第三階段（2013至2020年）共有約21億配額，所以配額過剩問題在短期內不會緩解。歐洲委員會試圖通過短期和長期措施解決這一問題。

歐盟排放配額二級市場成交量及價格趨勢圖

（2015年1月-10月23日，價格：歐元/噸；成交量：百萬噸）

短期措施：第三階段“推遲配額”拍賣(Back-loading)作為解決配額過剩問題的短期措施，歐委會決定推遲拍賣9億配額，到2019—2020年再重新回注到拍賣市場當中。所以，“推遲配額”拍賣量并非減少第三階段的配額數量，只是在該階段重新分配拍賣數量。2014-2016年分別減少的拍賣數量為：2014年減少4億配額，2015年減少3億配額，2016年減少2億配額。推遲配額拍賣在短期內能重新平衡供給和需求，在對競爭力不造成影響的前提下減少價格波動。推遲配額拍賣于2014年2月27日生效的EU ETS拍賣條例修正案中正式通過。

EU ETS 2014年實施Back-loading措施，推遲了4億配額拍賣。這使得2014年EUETS排放量（需求量）自2008年來首次超過拍賣及免費分配的配額量（供給量）。加上對《京都議定書》中國際抵消信用的購買量，2014年的配額供需基本實現平衡。但是歐盟配額(EU Allowance, EUA)過剩量仍然在21億左右。

歐委會提出建立市場穩定儲備作為長期措施，對EU ETS實施結構性改革。市場穩定儲備將：解決目前的配額過剩問題；通過調整拍賣配額數量，提高體系對外界沖擊的抵抗能力。立法提案于2014年1月與2030年氣候和能源政策框架一同提出，歐洲議會于2015年7月6日批準。預計2018年正式設立MSR，2019年1月進行第一次調節性拍賣。2017年5月15日開始，歐委會每年會發布配額流通量(allowances incirculation, AiCs)報告，配額流通量等于EUA簽發量和國際抵消信用使用量之和減去EU ETS的核證排放量（自2008年起），再減去MSR配額量。AiCs計算時間為從前一年到本年的12月31日為止。例如，在運行第一年（2019年）的1月至8月期間，僅會從配額拍賣量中減去8%的AiCs，即每個月減少1%。如果AiCs少于4億，拍賣市場會隨機增加1億配額拍賣量。

而且，MSR提案提出以下配額會被儲存在MSR中：推遲拍賣的配額、新增設施配額儲備(New Entrants Reserve, NER)中沒有使用的配額、運營商由于停產或關閉而返還的配額。這些配額將于2020年被存入MSR中，其他未使用的配額或者未分配的配額將由相關成員國進行拍賣。預計從2015年開始，過剩配額量將逐年下降，到2030年，過剩配額量將會被MSR完全吸收。

解決市場不平衡的努力還包括降低排放總量。在第四階段，即從2021年開始，排放總量將每年降低2.2%，目前是每年降低1.74%。2015年7月，歐洲委員會公布了2020年后修正EU ETS立法提案。這是實現EU到2030年溫室氣體至少減排40%的目標所邁出的第一步。該提案不僅與2030年氣候和能源政策一致，也表示了EU ETS對12月巴黎氣候峰會的支持。

為了實現歐盟至少降低40%的目標，與2005年相比，納入行業必須減少43%的碳排放。從2021年開始，排放總量將每年降低2.2%，目前是每年降低1.74%。

提案還包括應對碳泄漏風險的相關規則，以防止生產轉移到氣候政策較為寬松的國家。包括：修改免費分配體系，重點關注可能把生產轉移到歐盟之外的高風險行業——共約50種行業；為新增設施預留免費配額；制定更靈活的規則，協調免費配額數量和生產數量；自2008年之后更新基準線，以真實反映科技進步情況；在2021年至2030年，預計向納入企業免費分配大約63億配額，價值1600億歐元。

在向低碳經濟轉型期，EUETS將出臺支持幫助發電企業應對創新及投資挑戰的措施。包括建立創新基金和現代化基金。在低收入成員國仍將獲得免費配額以實現電力行業現代化。