據了解，我國碳排放交易配額分配制度的構建仍需秉持公平與效率、環境效果與產業競爭力保護四個基本原則。在我國碳排放交易制度引入國民經濟體系的初始階段，涵蓋產業和企業的過渡期適應將是中央決策者主要的考慮因素。一方面，產業競爭力的保護要優先于環境效果，尤其是我國目前所處的工業化中期發展階段，經濟增長并沒有完全實現與碳排放脫鉤，在排放峰值帶來之前很難實現真正的總量約束控制；另一方面，配額分配工作的實施效率優先于實施公平性，以避免給政府造成過高的管理成本。而在我國碳排放交易制度正常運行的高級階段，產業競爭力保護應當逐步讓位于環境效果因素，通過強有力的溫室氣體配額管理和排放約束，促使納入產業實現自身的技術改造和低碳轉型。配額分配工作的公平性必須是決策者首要重視的問題，通過設計更加復雜精密的分配規則，強化數據收集、基準制定、分配執行和實施過程的監管，保障配額分配真正有利于排放水平的降低，有利于進行低碳技術革新的企業發展，實現配額分配制度在事先設計、分配實施和分配效果多領域的公平效果。

中國碳排放交易配額分配制度的基本方式。在配額分配方法的適用上，仍然需要中央決策者根據我國碳排放交易制度的發展階段進行選擇和方法組合。在國家碳交易啟動的初始階段，分配方法應以無償分配為主，以有償分配作為必要補充，在無償分配中以祖父法作為主體，個別產品實現標準化的產業部門初步采用基準法則。有償分配的有限適用主要考慮到我國配額二級市場初期發展的不成熟，需要幫助涵蓋企業在期末進行履約獲得配額的購買途徑。在中國國家碳交易的成熟階段，分配方法應以有償分配為主體，以無償分配作為必要補充。有償分配將以配額拍賣作為主要手段，實現環境損害真正內部化為企業的排放成本，配額收入將進入到國家建立的應對氣候變化專項基金，資助減緩和適應氣候變化項目，同時可以用來補貼易受配額成本影響的弱勢群體。無償分配轉變為輔助手段后也有其繼續存在的必要性，可以用于防止碳泄漏的發生以及對國民經濟重要產業部門的競爭力保護。在配額分配的層級選擇上，由于我國碳排放交易制度覆蓋范圍的多產業特點，基于不同產業的多層級分配是最佳路徑。